Коли бухгалтер отримує офіційну підготовку в процесі аудиту, розглянуті теми стосуються основних видів аудитів, які, ймовірно, будуть використовуватися в різних галузях. Хоча це корисно, цього тренінгу недостатньо у випадках, коли аудит заглиблюється у галузі, які потребують вузькоспеціалізованих знань. Спеціалізований аудит виникає, коли бізнес-процес був змінений відповідно до вимог конкретної галузі. Налаштування процесу відбувається певною мірою в будь-якій галузі. Таким чином, загальноосвітній аудитор може виявити, що процес виставлення рахунків помітно відрізняється порівняно з тим, що використовується у страховій галузі або в галузі бронювання авіакомпаній.
Один із варіантів полягає в тому, щоб аудитор отримав необхідну підготовку в спеціалізованій галузі, яка підлягає аудиту, хоча це може зажадати значної кількості часу, і спочатку аудитор може бути не надто ефективним. Більш ефективною та дієвою альтернативою є призначення спеціалістів на аудит для роботи в цих сферах. Спеціаліст особливо цінний, якщо він або вона має великий досвід роботи у цій галузі, або розробив або впровадив подібні системи.
Особливо рекомендується використовувати спеціаліста, коли тема - це не просто аудит, а також надання рекомендацій щодо вдосконалення. Оскільки фахівець глибоко знає предметну область, будь-які рекомендації можуть призвести до економії, яка значно перевищує вартість аудиту.
Спеціаліст не стає постійним членом аудиторської групи. Натомість спеціаліст використовується лише за потреби, а потім повертається до бізнес-підрозділу, де він або вона зазвичай працює.